Не само Рилския манастир, но и неговите метоси в околността са посещавани от партизани. Така става и в Рилския метох в село Рила. Винаги там има монах, пратеник от манастира на послушание, който ръководи работата там и служи в храма. Нарича се „иконом“, което значи „домакин-управител“.

По време на партизанското движение една нощ дошъл партизанин да моли за помощ. Икономът йеромонах Аверкий го приема. Скоро обаче от полицията го откриват. Арестуват го и го съдят. Икономът е призован служебно за свидетел. Подробности не се знаят, но с положителност се твърди от летописеца на манастира, че отец Аверкий не го предава.

След 9 септември 1944 г. започва жестоко отмъщение. Без съд и присъда се изтезават и убиват невинни хора, уличени в престъпления. През нощта срещу 25 октомври 1944 г. в 12 часа в полунощ пред метоха в Рила спира служебна лека кола. Отправят се към килията на дядо Аверкий. Връзват му ръцете отзад, необлечен и бос го отвеждат до колата. Повече никой не го вижда и чува. Без съмнение той е бил убит.